всероссийский научно-практический журнал
  • ISSN 2072-8158
  • -
  • Роспечать: 48626
  • Пресса России: 44722

Анализ пцр-генотипов штаммов V. cholerae О1, однократно обнаруженных в поверхностных водоемах на территории России

Опубликовано в журнале «Вода: химия и экология» № 11 за 2017 год, стр. 119-124.
Рубрика: Гидробиология

 

Кругликов В.Д. доктор медицинских наук, заведующий лабораторией микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Левченко Д.А. младший научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Титова С.В. кандидат медицинских наук, директор, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Архангельская И.В. научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт
Водопьянов А.С. кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник, руководитель группы вирусологии, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Непомнящая Н.Б. научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Ежова М.И. научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Гаевская Н.Е, кандидат медицинских наук, заведующая лабораторией бактериофагов, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Квасов А.Р. профессор, доктор медицинских наук, заведующий кафедрой гигиены, ФГБОУ ВО Ростовский государственный медицинский университет Минздрава России

Аннотация:
Работа посвящена изучению с помощью разработанной геоинформационной системы (ГИС), интегрированной в геоинформационный портал ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора, штаммов V. cholerae, которые однократно выделялись в течение периода с 1989 г. по 2016 г. из разных водных объектов окружающей среды (ООС) на территории Российской Федерации и определению резонации этого явления с генотипами данных культур. Генотипирование проводилось методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) по детекции 14 генов. Были отобраны 12 штаммов, которые относились только к холерным вибрионам О1 серогруппы Эль Тор, из них: 10 штаммов были типичны по родовым и видовым свойствам, а два штамма были идентифицированы как атипичные — V. cholerae R-вариант. Установлено, что культуры отобранных нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 в течение исследуемого периода однократно обнаруживались в пяти федеральных округах (ФО) России, девяти административных территорий и в девяти водных ООС. Определены генотипы выбранных штаммов — В8-В10 и Е10. Установлены связи генотипической характеристики штаммов с их персистентным потенциалом и возможностью переживания в водных экосистемах до нескольких лет. Показано, что штаммы холерных вибрионов О1 с генотипом В8, наряду со штаммами имеющими иную генотипическую характеристику, выделялись, начиная с 1998 г. из водных ООС на разных территориях страны, но тоже однократно, что свидетельствовало об их заносном характере и невозможностью длительного переживания в условиях умеренного климата. Отмечено, что штаммы V. cholerae О1 с уникальными генотипами В9 и Е10 ранее и позднее их выделения не встречались в водных ООС на территории субъектов Российской Федерации. Таким образом, использование авторской ГИС с возможностью отражения результатов ПЦР-генотипирования способствует повышению эффективности научно-методического обеспечения мониторинговых исследований в рамках эпиднадзора за холерой на территории Российской Федерации.

Ключевые слова: водные объекты окружающей среды, генотип, геоинформационная система, холерные вибрионы, экология

Ссылка для цитирования:
Кругликов В.Д., Левченко Д.А., Титова С.В., Архангельская И.В., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Ежова М.И., Гаевская Н.Е,, Квасов А.Р. Анализ пцр-генотипов штаммов V. cholerae О1, однократно обнаруженных в поверхностных водоемах на территории России // Вода: химия и экология. — 2017. — № 11. — c. 119-124. — http://watchemec.ru/article/28831/

Литература:
1. Москвитина Э.А. Эпидемиологическая обстановка по холере в мире и России в 2007-2016 гг., прогноз на 2017 г. / Э.А. Москвитина, Е.Г. Тюленева, А.В. Самородова, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, С.М. Иванова, Т.В. Ковалева, Г.Б. Анисимова // Пробл. особо опасных инф. 2017. №1. С. 13-23.
2. Куликалова Е.С. Биопленка холерного вибриона: получение, характеристика и роль в резер- вации возбудителя в водной окружающей среде
/ Е.С. Куликалова, Л.Я. Урбанович, С.Г. Саппо, Л.В. Миронова, Е.Ю. Марков, В.В. Мальник, В.М. Корзун, С.К. Миткеева, С.В. Балахонов // Журн. микобиол., эпидемиол., иммунол. 2015. №1. С. 3-11.
3. Кульшань Т.А. Генетические изменения вирулентных штаммов холерных вибрионов биовара Эль Тор при их обитании в водной среде / Т.А. Кульшань, А.В. Топорков, Н.И. Смирнова // Пробл. особо опасных инф. 2006. 1. С. 41-44.
4. Кульшань Т.А. Сравнительный анализ участков генома, связанных с вирулентностью, у природных штаммов Vibrio cholerae классического и Эль Тор биоваров / Т.А. Кульшань, Н.Б. Челдышова, Н.П. Гусева, Н.И. Смирнова // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014. №2. С. 26-33.
5. Кульшань Т.А. Анализ молекулярно-генетических особенностей штаммов Vibrio cholerae классического и Эль Тор биоваров: Автореф. Дисс.… канд. мед. наук. Саратов, 2013. 12 с.
6. Онищенко Г.Г. Актуальные проблемы эпидемиологического надзора, лабораторной диагностики и профилактики холеры в Российской Федерации / Г.Г. Онищенко, А.Ю. Попова, В.В. Кутырев, Н.И. Смирнова, С.А. Щербакова, Э.А. Москвитина, С.В. Титова // Журн. миробиол., эпидемиол., иммунол. 2016. №1. С. 89-101.
7. Титова С.В. Холера: оценка эпидемиологичской обстановки в мире и России в 2006-2015 гг. прогноз на 2016 год / С.В. Титова, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, А.В. Самородова, Е.Г. Тюленева, Е.В. Монахова, Р.В. Писанов, А.С. Водопьянов, И.В. Архангельская, С.М. Иванова, Т.В. Ковалева, С.О. Водопьянов // Пробл. особо опасных инф. 2016. №1. С. 20-27.
8. Ломов Ю.М. Мониторинг вибриофлоры водных объектов окружающей среды в системе эпиднад- зора за холерой / Ю.М. Ломов, Н.Р. Телесманич, В.Д. Кругликов, Е.П. Авдеева, М.И. Ежова, И.С. Шестиалтынова, О.А. Шалу, Н.Б. Непомнящая, И.В. Архангельская // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010. №5. С. 24-28.
9. Ежова М.И. Мониторинг водных объектов на наличие холерных вибрионов / М.И. Ежова, И.В. Архангельская, Л.В. Григоренко, И.С. Шестиалтынова, А.Б. Мазрухо, Д.И. Каминский // Здравоохранение Российской Федерации. 2011. №5. С. 40a.
10. Васильева О.В. Создание информационной системы «Холера на Кавказе» / О.В. Васильева, С.И. Москвитина, В.Н. Савельев, Б.В. Бабенышев // Инфекция и иммунитет. 2012. Т. 2, №1-2. С. 126.
11 Москвитина Э.А. Характеристика эпидемиологической обстановки по холере в мире (2003– 2012 гг.) и прогноз на 2013 г. / Э.А. Москвитина, А.Б. Мазрухо, О.Л. Адаменко, О.А. Арешина, А.А. Назаретян, В.Д. Кругликов, С.М. Иванова, Д.А. Козина // Пробл. особо опасных инф. 2013. №1. С. 11-17.
12. Москвитина Э.А. Холера: эпидемиологическая обстановка в мире в 2005-2014 г. Прогноз на 2015 г. / Э.А. Москвитина, О.Л. Адаменко, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, Е.В. Монахова, Р.В. Писанов, С.М. Иванова, Г.Б. Анисимова // Пробл. особо опасных инф. 2015. №1. С. 18-25.
13. Гриднева Л.Г. Результаты мониторинга и биологические свойства холерных вибрионов, изолированных из объектов окружающей среды на территории Хабаровского края / Л.Г. Гриднева, Ю.С. Мусатов, Т.В. Громова, Н.М. Пуховская, Н.Б. Белозерова, О.М. Уткина, Л.И. Иванов, А.Г. Ковальский, Л.В. Миронова, Е.С. Куликалова, Ж.Ю. Хунхеева, С.В. Балахонов // Пробл. особо опасных инф. 2014. №1. С. 121-124.
14. Балахонов С.В. Эколого-микробиологические аспекты эпиднадзора за холерой / С.В. Балахонов, Л.Я. Урбанович, Е.С. Куликалова // По материалам Сибири и Дальнего Востока. Saarbrücken: LAP LAMBERT Academic Pablishing, 2013. 196 c.
15. Зубкова Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Шестиалтынова И.С., Архангельская И.В., Ежова М.И., Ускова Н.Н. Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2014621055. Геоинформационная система. Холера 1989-2014, 2014.
16. Левченко Д.А. ГИС: возможности анализа данных фено- и генотипирования холерных вибрионов О1 Эль Тор, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории Российской Федерации / Д.А. Левченко, В.Д. Кругликов, А.С. Водопьянов, С.В. Титова, И.В. Архангельская, Н.Б. Непомнящая, М.И. Ежова // Журн. миробиол., эпи- демиол., иммунол. 2016. №6. С. 19-25.
17. Монахова Е.В. Факторы патогенности нехолерогенных штаммов холерных вибрионов. Дис.… д-ра биол. наук. Ростов-н/Д., 2012. 46 с.
18. Boyd E.F. Molecular analysis of a putative СТХφ precursor and evidence for independent acquisition of distinct СТХφs by toxigenic Vibrio cholerae / E.F. Boyd, A.J. Heilpern, M.K. Waldor // J. Bacteriol. 2000. Vol. 182, N 19. P. 5530-5538.
19. Chow K.H. Detection of RTX toxin in Vibrio cholerae by PCR / K.H. Chow, N.K. Ng, K.Y. Yuen, W.C. Yam // J. Clin. Microbiol. 2001. Vol. 39, N 7. P. 2594-2597.
20. Dzeijman M. Genomic characterization of non-O1, non-O139 Vibrio cholerae reveals genes for a type III secretion system / M. Dzeijman, D. Serruto, V.C. Tam // Proc. Natl. Acad. Sci. 2005. Vol. 102, N9. P. 3465- 3470.
21. Fullner Satchell K.J. MARTX, multifunctional autoprocessing repeats-in-toxin toxins // Infect. Immun. 2007. Vol.75, N11. P. 5079-5084.
22. Jermyn W.S. Characterization of a novel Vibrio pathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates / W.S. Jermyn, E.F. Boyd // Microbiology. 2002. Vol.148. P. 3681-3693.
23. Waldor M.K. Regulation, replication and integration functions of the Vibrio cholerae CTXf Watnick P.I. A role for the mannose-sensitive hemagglutinin in biofilm formatom by Vibrio choleraeO1 El Tor / P.I. Watnick, K.J. Fullner, R.A. Kolter // J. Bacteriol. 1999. Vol. 181. P. 3606-3609.
24. Левченко Д.А. Гено— и фаготипы нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории России в 2016 г. / Д.А. Левченко, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, И.В. Архангельская, А.С. Водопьянов, Н.Б. Непомнящая, Н.Е. Гаевская, М.И. Ежова // Вода: химия и экология. 2017. №7. С. 17-24.