всероссийский научно-практический журнал
  • ISSN 2072-8158
  • -
  • Урал-Пресс: 012688

Гено– и фаготипы нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории России в 2016 г.

Опубликовано в журнале «Вода: химия и экология» № 7 за 2017 год, стр. 17-24.
Рубрика: Мониторинг водных объектов

 

Левченко Д.А. младший научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Кругликов В.Д. доктор медицинских наук, заведующий лабораторией микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Титова С.В. кандидат медицинских наук, директор, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Архангельская И.В. научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт
Водопьянов А.С. кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник, руководитель группы вирусологии, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Непомнящая Н.Б. научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Гаевская Н.Е, кандидат медицинских наук, заведующая лабораторией бактериофагов, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Ежова М.И. научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора

Аннотация:
На современном этапе развития седьмой пандемии холеры на территории Российской Федерации случаи заболевания холеры Эль Тор регистрировалась в виде отдельных заносных случаев без распространения, редких групповых заболеваний и транзиторных носителей. Наряду с этим, а также в отсутствии эпидосложнений по этой инфекции, наблюдалось ежегодное обнаружение нетоксигенных V. cholerae в водных объектах окружающей среды, что обусловлено их экологическими особенностями.
Целью исследования явилось определение ПЦР-генотипов нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, изолированных из водных экосистем на территории России в 2016 г. С помощью геоинформационной системы (ГИС) «Холера 1989-…» были проанализированы фено- и генотипические свойства 53 нетоксигенных изолятов. Было выявлено четыре атипичных штамма по признаку агглютинабельности (Р-вариант).
Принадлежность к определенному фаготипу установлена у 38,5 % штаммов V. cholerae О1. На территориях Свердловской обл. и Хабаровского края выделены нетоксигенные культуры V. cholerae с ранее там не встречавшимися фаготипами.
На основании детекции оптимального количества (14) генов факторов патогенности, изоляты были сгруппированы в 4 кластера. На территориях Ростовской обл. и Забайкальского края были изолированы штаммы холерных вибрионов с одинаковыми генотипами (А2 и А6). В Республике Крым и Свердловской обл. обнаружены культуры с генотипами А7, А5, А8, соответственно.
Полученные результаты не исключают возможности заноса культур V. cholerae с генотипами А2 и А6 из одного региона. Пополнение ГИС данными, основанными на ПЦР-генотипировании V. сholerae О1, позволяет получать информацию о возможном происхождении как вновь выделенных, так и ранее полученных изолятов.

Ключевые слова: водные объекты окружающей среды, гено- и фаготипы, геоинформационная система, холерные вибрионы, экология

Ссылка для цитирования:
Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Титова С.В., Архангельская И.В., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Гаевская Н.Е,, Ежова М.И. Гено– и фаготипы нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории России в 2016 г. // Вода: химия и экология. — 2017. — № 7. — c. 17-24. — http://watchemec.ru/article/28594/

Литература:
1. Москвитина Э.А. Холера: эпидемиологическая обстановка в мире в 2005-2014 г. Прогноз на 2015 г. / Э.А. Москвитина, О.Л. Адаменко, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, Е.В. Монахова, Р.В. Писанов, С.М. Иванова, Г.Б. Анисимова // Пробл. ООИ. 2015. № 1. С. 18-25.
2. Ежова М.И. Мониторинг водных объектов на наличие холерных вибрионов / М.И. Ежова, И.В. Архангельская, Л.В. Григоренко, И.С. Шестиалтынова, А.Б. Мазрухо, Д.И. Каминский // Здравоохранение Российской Федерации. 2011. № 5. С. 40.
3. Ломов Ю.М. Мониторинг вибриофлоры водных объектов окружающей среды в системе эпиднадзора за холерой / Ю.М. Ломов, Н.Р. Телесманич, В.Д. Кругликов, Е.П. Авдеева, М.И. Ежова, И.С. Шестиалтынова, О.А. Шалу, Н.Б. Непомнящая, И.В. Архангельская // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010. № 5. С. 24-28.
4. Москвитина Э.А. Эпидемиологическая обстановка по холере в мире в 2013 г., прогноз на 2014 г. / Э.А. Москвитина, О.Л. Адаменко, И.В. Дворцова, В.Д. Кругликов, С.М. Иванова, Д. А. Козина // Проблемы ООИ. 2014. № 2. С. 19-26.
5. Савельев В.Н. Эволюция возбудителя и клинико-эпидемиологические особенности современной холеры Эль-Тор / В.Н. Савельев, И.В. Савельева, Б.В. Бабенышев, A.Н. Куличенко // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2012. № 5. С. 31-35.
6. Левченко Д.А. Анализ регистрации заболеваний острыми кишечными инфекциями, вызванными штаммами холерных вибрионов О1, лишенных гена холерного токсина / Д.А. Левченко, В.Д. Кругликов, И.В. Архангельская, Н.Б. Непомнящая, А.С. Водопьянов, Э.А. Москвитина, С.В. Титова // Актуальные вопросы диагностики и профилактики инфекционных и паразитарных заболевании на Юге России. Ростовский научно-исследовательский институт микробиологии и паразитологии Роспотребнадзора. 2016. С. 112-116.
7. Кругликов В.Д. Генотипическая и фенотипическая характеристика штаммов холерных вибрионов, выделенных от людей и из объектов окружающей среды во время эпидосложнения по холере в Каменском районе Ростовской области в 2005 году / В.Д. Кругликов, Б.Л. Мазрухо, Е.П. Авдеева, Е.В. Монахова, И.С. Шестиалтынова, Н.К. Михась, В.В. Сухарь, Т.А. Кудрякова, Г.В. Качкина, А.Б. Мазрухо, Э.Г. Цедова, Каминский Д.И. // Холера и патогенные для человека вибрионы: Материалы проблемной комиссии. Р-н/Д.: «Мини Тайп», 2006. С. 37-39.
8. Осина Н.А. Результаты мониторинга холерных вибрионов в водных экосистемах на территории Республики Калмыкия / Н.А. Осина, Т.Б. Каляева, Т.В. Бугоркова, И.А. Касьян, Н.Ф. Оброткина // ЗНиСО. 2013. № 2 (239). С. 28-30.
9. Смирнова Н.И. Генетическая характеристика клинических штаммов Vibrio cholerae, завезенных на территорию Российской Федерации в современный период / Н.И. Смирнова, А.А. Горяев, С.П. Заднова // Микробиология. 2010. № 3. С. 3-10.
10. Титова С.В. Холера: оценка эпидемиологичской обстановки в мире и России в 2006-2015 гг. прогноз на 2016 год / С.В. Титова, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, А.В. Самородова, Е.Г. Тюленева, Е.В. Монахова, Р.В. Писанов, А.С. Водопьянов, И.В. Архангельская, С.М. Иванова, Т.В. Ковалева, С.О. Водопьянов // Пробл. ООИ. 2016. № 1. С. 20-27.
11. О заседании Ученого совета Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 15.12.2016 г. Электронный ресурс: http://rospotrebnadzor.ru/about/info/news/news_details.php?ELEMENT_ID=7531.
12. Зубкова Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Шестиалтынова И.С., Архангельская И.В., Ежова М.И., Ускова Н.Н. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2014621055. Геоинформационная система. Холера 1989-2014, 2014.
13. Soumen C. Virulence Genes in Enviromental Strains of Vibrio cholerae / C. Soumen, K.M. Asish, K.B. Rupak // Appl. And Environ. Microbiol. 2000. V. 66. N 9. Р. 4022-4028.
14. Boyd E.F. Molecular analysis of a putative СТХφ precursor and evidence for independent acquisition of distinct СТХφs by toxigenic Vibrio cholerae / E.F. Boyd, A.J. Heilpern, M.K. Waldor // J.Bacteriol. 2000. V. 182. N 19. P. 5530-5538.
15. Waldor M.K. Regulation, replication and integration functions of the Vibrio cholerae CTX are encoded by region RS2 / M.K. Waldor, E.J. Rubin, D.N. Gregory // Mol.Microbiol. 1997. V. 24. P. 917-926.
16. Водопьянов С.О. Разработка способа выявления гена tcpA холерного вибриона биотипа эльтор и сероварианта О139 Бенгал с помощью полимеразной цепной реакции / С.О. Водопьянов, Б.Н. Мишанькин, И.П. Олейников // Биотехнология. 1999. № 6. С.19-23.
17. Левченко Д.А. ГИС: возможности анализа данных фено- и генотипирования холерных вибрионов О1 Эль Тор, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории Российской Федерации / Д.А. Левченко, В.Д. Кругликов, А.С. Водопьянов, С.В. Титова, И.В. Архангельская, Н.Б. Непомнящая, М.И. Ежова // ЖМЭиИ. 2016. № 6. С. 19-25.
18. Rivera I.N.G. Genotypes associated with virulence in environmental isolates of Vibrio cholerae / I.N.G. Rivera, J. Chun, A. Huq // Appl.Environ.Microbiol. 2001. V. 67. N 6. P. 2421-2429.
19. Jermyn W.S. Characterization of a novel Vibrio pathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates / W.S. Jermyn, E.F. Boyd // Microbiology. 2002. V. 148. P. 3681-3693.
20. Chow K.H. Detection of RTX toxin in Vibrio cholerae by PCR / K.H. Chow, N.K. Ng, K.Y. Yuen, W.C. Yam // J.Clin.Microbiol. 2001. V. 39. N 7. P. 2594-2597.
21. Fullner Satchell K.J. MARTX, multifunctional autoprocessing repeats-in-toxin toxins // Infect. Immun. 2007. V. 75. N 11. P. 5079-5084.
22. Sheahan K.-L. Identification of a domain within the multifunctional Vibrio cholerae RTX toxin that covalently cross-links actin / K.-L. Sheahan, C.L. Cordero, K.J. Fullner Satchell // Proc.Natl.Acad.Sci. USA. 2004. V. 101. N 26. P. 9798-9803.
23. Watnick P.I. A role for the mannose-sensitive hemagglutinin in biofilm formatom by Vibrio choleraeO1 El Tor / P.I. Watnick, K.J. Fullner, R.A. Kolter // J. Bacteriol. 1999. V. 181. P. 3606-3609.
24. Монахова Е.В. Факторы патогенности нехолерогенных штаммов холерных вибрионов. Дис. … д-ра биол. наук. Ростов-н/Д., 2012. 46 с.
25. Dzeijman M. Genomic characterization of non-O1, non-O139 Vibrio cholerae reveals genes for a type III secretion system / M. Dzeijman, D. Serruto, V.C. Tam // Proc.Natl.Acad.Sci. 2005. V. 102. N 9. P. 3465-3470.
26. Faruque S.M. Molecular ecology of toxigenic Vibrio cholerae / S.M. Faruque, G.B. Nair // Microbiol. Immunol. 2002. V. 46. P. 59-66.
27. МУК 4.2.2870-11 Порядок организации и проведения лабораторной диагностики холеры для лабораторий территориального, регионального и федерального уровней. Ростов-н/Д.: с. 76.
28. Методические указания по применению прямого фаготипирования возбудителя холеры Эль Тор.- Сост.: Дрожевкина М.С., Арутюнов Ю.И. «Москва». 1983.-10 с.
29. Гаевская Н.Е. Использование бактериофагов в лабораторной диагностике холеры / Н.Е. Гаевская, Л.Д. Македонова // Клин. лаб. диагностика. 2016. Т.61, №12. С. 849-852.