всероссийский научно-практический журнал
  • ISSN 2072-8158
  • -
  • Роспечать: 48626
  • Пресса России: 44722

Гетерогенность популяций органотрофных микроорганизмов на внешних покровах больных рыб

Опубликовано в журнале «Вода: химия и экология» № 04 за 2016 год, стр. 32-49.
Рубрика: Гидробиология

 

Белькова Н.Л. кандидат биологических наук, доцент, старший научный сотрудник отдела микробиологии ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук
Деникина Н.Н. кандидат биологических наук, доцент, старший научный сотрудник лаборатории аналитической биоорганической химии, ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук
Суханова Е.В. кандидат биологических наук, научный сотрудник отдела микробиологии, ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук
Пастухов В.В. руководитель группы аквариумных экспозиций, Байкальский музей Иркутского научного центра Сибирского отделения Российской академии наук
Дзюба Е.В. кандидат биологических наук, заведующий лабораторией ихтиологии, ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук

Аннотация:
Результаты молекулярно-генетических исследований показывают, что бактерии, относящиеся к микробиоте внешних покровов рыб, очень разнообразны, а состав и структура бактериальных популяций зависят от окружающей водной среды и от вида рыб. Цель настоящего исследования - идентификация органотрофных микроорганизмов, изолированных с внешних покровов больных рыб из экспозиционных аквариумов. Из соскобов культивировали микроорганизмы, принадлежащие широко распространенным в пресных водоемах родам: Acinetobacter, Aeromonas, Pseudomonas, Flavobacterium, Janthinobacterium и Shewanella. Среди изолированных штаммов определены природные, автохтонные и потенциально патогенные для рыб виды. Идентификация бактерий выявила гетерогенность популяций Aeromonas, Acinetobacter, Pseudomonas и Shewanella. Среди этих микроорганизмов отмечены штаммы, охарактеризованные как патогены рыб, которые могут выступать первичными инфекционными агентами: Aeromonas sobria, A. salmonicida subsp. salmonicida, Acinetobacter johnsonii, Pseudomonas baetica и Shewanella putrefaciens. При проведении микробиологического мониторинга состояния среды обитания в условиях искусственного содержания рыб необходимо учитывать эти виды органотрофных микроорганизмов.

Ключевые слова: Abramis brama, Acinetobacter, Aeromonas, Cottocomephorus grewingkii, Shewanella, внешние покровы, гетеротрофные микроорганизмы, молекулярно-генетические методы

Ссылка для цитирования:
Белькова Н.Л., Деникина Н.Н., Суханова Е.В., Пастухов В.В., Дзюба Е.В. Гетерогенность популяций органотрофных микроорганизмов на внешних покровах больных рыб // Вода: химия и экология. — 2016. — № 04. — c. 32-49. — http://watchemec.ru/article/27918/

Литература:
1.Cahill M.M. Bacterial flora of fishes: A review // Microb. Ecol. 1990. V. 19. № 1. P. 21-41.
2. Boutin S. Inter individual variations of the fish skin microbiota: host genetics basis of mutualism? / S. Boutin, C. Sauvage, L. Bernatchez, C. Audet, N. Derome // PLoS One. 2014. V. 9. №7. e102649.
3. Wilson B. The diversity of bacterial communities associated with Atlantic cod (Gadus morhua) / B. Wilson, B. Danilowicz, W. Meijer // Microb. Ecol. 2008. V. 55. P. 425-434.
4. Wang W. Identification of the adherent microbiota on the gills and skin of poly-cultured gibel carp (Carassius auratus gibelio) and bluntnose black bream (Megalobrama amblycephala Yih) / W. Wang, Z. Zhou, S. He, Y. Liu, Y. Cao, P. Shi, B. Yao, E. Ringo // Aquac. Res. 2010. V. 41. e72-e83.
5. Svanevik C.S. Characterization of the microbiota of atlantic mackerel (Scomber scombrus) / C.S. Svanevik, B.T. Lunestad // Int. J. Food Microbiol. 2011. V. 151. P. 164-170.
6. Larsen A. Diversity of the skin microbiota of fishes: evidence for host species specificity / A. Larsen, Z. Tao, S.A. Bullard, C.R. Arias // FEMS Microb. Ecol. 2013. V. 85. P. 1-12.
7. Leonard A.B. The skin microbiome of Gambusia affinis is definedand selective / A.B. Leonard, J.M. Carlson, D.E. Bishoff, S.I. Sendelbach, S.B. Yung, S. Ramzanali, A.B.W. Manage, E.R. Hyde, J.F. Petrosino, T.P. Primm // Adv. Microbiol. 2014. V. 4. P. 335-343.
8. Burr S.E. Heterogeneity of Aeromonas populations in wild and farmed perch, Perca fluviatilis L. / S.E. Burr, E. Goldschmidt-Clermont, P. Kuhnert, J. Frey // J. FishDis. 2012. V. 35. № 8. P. 607-613.
9. Белькова Н.Л. Молекулярно-генетический мониторинг ассоциированной микрофлоры лососевидных рыб: разнообразие и физиологический статус / Н.Л. Белькова, Е.В. Суханова, Н.Н. Деникина, О.Т. Русинек, Е.В. Дзюба // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2010. Т. 12. № 1 (4). С. 1108-1114.
10. Суханова Е.В. Идентификация микроорганизмов, вызывающих бактериальные инфекции внешних покровов рыб в аквариумных экспозициях / Е.В. Суханова, Е.В. Дзюба, Н.Н. Деникина, О.Т. Русинек, Н.Л. Белькова // Мат. междунар. науч. конф. «Актуальные вопросы деятельности академических естественно-научных музеев». Новосибирск: Академическое издательство «ГЕО», 2010. С. 165-169.
11. Пастухов В.В. Методы и условия содержания байкальских гидробионтов // Мат. междунар. науч. конф. «Актуальные вопросы деятельности академических естественно-научных музеев». Новосибирск: Академическое издательство «ГЕО», 2010. С. 131-134.
12. Белькова Н.Л. Молекулярно-генетические методы анализа микробных сообществ / Разнообразие микробных сообществ внутренних водоемов России: Учебно-методическое пособие. / Под ред. А.М. Андреевой. Ярославль: Изд-во ООО «Принтхаус». 2009. С. 53-63.
13. Белькова Н.Л. Видовое разнообразие глубоководных микроорганизмов озера Байкал, выявленное по последовательностям 16S рРНК / Н.Л. Белькова, Л.Я. Денисова, Е.Н. Манакова, Е.Ф. Зайчиков, М.А. Грачев // Докл. РАН. 1996. Т. 348. № 5. С. 692-695.
14. Белькова Н.Л. Характеристика биоразнообразия микробного сообщества водной толщи озера Байкал / Н.Л. Белькова, В.В. Парфенова, Т.Я. Косторнова, Л.Я. Денисова, Е.Ф. Зайчиков // Микробиология. 2003. Т. 72. № 2. С. 239-249.
15. Skrodenyte-Arbaciauskiene V. Identification of Aeromonas salmonicida in European perch from North Lithuanian rivers during mass mortalities in 2008 / V. Skrodenyte-Arbaciauskiene, N. Kazlauskiene, M.Z. Vosyliene, T. Virbickas // Cent. Eur. J. Biol. 2010. V. 5. № 6. P. 831-838.
16. Moore J.E. High diversity of bacterial pathogens and antibiotic resistance in salmonid fish farm pond water as determined by molecular identification employing 16S rDNA PCR, gene sequencing and total antibiotic susceptibility techniques / J.E. Moore, J. Huang, P. Yu, C. Ma, P.J. Moore, B.C. Millar, C.E. Goldsmith, J. Xu // Ecotoxicol. Environ. Saf. 2014. V. 108. P. 281-286.
17. Kozinska A. First isolation of Shewanella putrefaciens from freshwater fish – a potential new pathogen of the fish / A. Kozinska, A. Pezkala // Bull. Eur .Assoc. Fish Pathol. 2004. V. 24. P. 199-203.
18. Qin L. A new pathogen of gibel carp Carassius auratus gibelio– Shewanella putrefaciens / L. Qin, X. Zhang, K. Bi // Wei. Sheng. Wu. Xue. Bao. 2012. V. 52. № 5. P. 558-565.
19. Pezkala A. Phenotypical and genotypical characterization of Shewanella putrefaciens strains isolated from diseased freshwater fish / A. Pezkala, A. Kozińska, E. Paździor, H. Głowacka // J. Fish Dis. 2015. V. 38. № 3. P. 283-293.
20. Lopez J.R. Pseudomonas baetica sp. nov., a fish pathogen isolated from wedge sole, Dicologlossa cuneata (Moreau) / J.R. Lopez, A.L. Dieguez, A. Doce, E. DelaRoca, R. Dela Herran, J.I. Navas, A.E. Toranzo, J.L. Romalde // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2012. V. 62. Pt. 4. P. 874-882.