всероссийский научно-практический журнал
  • ISSN 2072-8158
  • -
  • Роспечать: 48626
  • Пресса России: 44722

Разработка молекулярных методов анализа биоразнообразия губок Байкала

Опубликовано в журнале «Вода: химия и экология» № 12 за 2014 год, стр. 66-71.
Рубрика: Гидробиология

 

Ицкович В.Б. кандидат биологических наук, научный сотрудник, ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук
Владимирова Д.О. студентка Биолого-почвенного факультета, ФГБОУ ВПО Иркутский государственный университет
Яковчиц А.В. студентка Биолого-почвенного факультета, ФГБОУ ВПО Иркутский государственный университет
Калюжная О.В. кандидат биологических наук, научный сотрудник, ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук

Аннотация:
Благодаря способности к биофильтрации и биоаккумуляции губки (Porifera) являются биоиндикаторами состояния водной среды. На Байкале губки составляют основную часть биомассы бентоса. Разработаны специфичные праймеры для амплификации ITS спейсерного района рРНК пресноводных губок. Проведено исследование полиморфизма ITS1 и ITS2 спейсеров рРНК у губок оз. Байкал, относящихся к семействам Lubomirskiidae и Spongillidae. Показана перспективность использования данного маркера для оценки биоразнообразия губок.

Ключевые слова: ITS1, ITS2, биоразнообразие, пресноводные губки, таксономия

Ссылка для цитирования:
Ицкович В.Б., Владимирова Д.О. , Яковчиц А.В. , Калюжная О.В. Разработка молекулярных методов анализа биоразнообразия губок Байкала // Вода: химия и экология. — 2014. — № 12. — c. 66-71. — http://watchemec.ru/article/26979/

Литература:
1. Li C.W. Precambrian sponges with cellular structures / Li C.W., Chen J.Y., Hua T.E. // Science. 1998. V. 249. P. 879–882.

2. Dröscher I. Abundance and microhabitats of freshwater sponges (Spongillidae) in a Danubean floodplain in Austria / Dröscher I, Waringer J // Freshwater Biology. 2007. V. 52. P. 998-1008.

3. Тимошкин О.А. Атлас и определитель пелагобионтов Байкала (с краткими очерками по их экологии) / О.А. Тимошкин, Г.Ф. Мазепова, Н.Г. Мельник и др. / Новосибирск: Наука, 1995. 659 C. 14.

4. Ефремова С.М. Губки // Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна / Под ред. О.А. Тимошкина и др. Новосибирск, Наука. 2001. Т. 1. С. 177–190.

5. Ефремова С.М. Новый род и новые виды губок сем. Lubomirskiidae Rezvoj, 1936 // Аннотированный список фауны озера Байкал и его водосборного бассейна / Под ред. О.А. Тимошкина и др. Новосибирск: Наука. 2004. Т. 2. С. 1261–1278.

6. Колтун В.М. Развитие индивидуальности и становление индивида у губок // Губки и Книдарии: современное состояние и перспектива исследований. Л.: Наука. 1988. 123 c.

7. Meixner M.J. Phylogenetic analysis of freshwater sponges provide evidence for endemism and radiation in ancient lakes / Meixner M.J., Luter C., Eckert C., Itskovich V., Janussen D., von Rintelen T., Bohne A.V., Meixner J.M., Hess W.R. // Mol. Phylogenet. Evol. 2007. V. 45. P. 875–86.

8. Itskovich V. Ribosomal ITS sequences allow resolution of freshwater sponge phylogeny with alignments guided by secondary structure prediction / Itskovich V, Gontcharov A, Masuda Y, Nohno T, Belikov S, Efremova S, Meixner M, Janussen D. // J. Mol. Evol.. 2008. V. 67 (6). P. 608-620.

9/ Ицкович В.Б. Исследование полиморфизма участков ядерной и митохондриальной ДНК у близкородственных видов эндемичных байкальских губок / В.Б. Ицкович, О.В. Калюжная, С.И. Беликов // Генетика. 2013. T. 49 (8). C. 966-974.

10. Harcet M. Taxonomic position of Eunapius subterraneus (Porifera, Spongillidae) inferred from molecular data – A revised classification needed? / Harcet M., Bilandzˇija H., Bruvo-Madarića,B., Ćetkovic H. // Mol. Phylogenet. Evol. 2010. V. 54. P. 1021–1027.

11. Erpenbeck D. Insights into the evolution of freshwater sponges (Porifera: Demospongiae: Spongillina): Barcoding and phylogenetic data from Lake Tanganyika endemics indicate multiple invasions and unsettle existing taxonomy. / Erpenbeck D., Weier T., de Voogd N.J., Wörheide G., Sutcliffe P., Todd J.A., Michel E. // Mol. Phylogenet. Evol. 2011. V. 61. P. 231–236.

12. Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. / Nucleic Acids Symp. 1999. Ser. 41. P. 95–98.

13. Tamura K. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods / Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, and Kumar S // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731-2739.

14. Ronquist F. MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. / Ronquist F., Huelsenbeck J.P. // Bioinformatics. 2003. V. 19. P. 1572–1574.

15. Lee Y.K. Microbial symbiosis in marine sponges / Lee Y.K., Lee J.H., Lee H.K. // J Microbiol. 2001. V. 39: P. 254-265.

16. Ицкович В.Б. Молекулярная филогения и систематика пресноводных губок / Автореф. дисс. канд. биол. наук. Владивосток, 2005.