всероссийский научно-практический журнал
  • ISSN 2072-8158
  • -
  • Роспечать: 48626
  • Пресса России: 44722

Штамм бактерий Rhodococcus wratislaviensis KM-Р – деструктор незамещенного пиридина

Опубликовано в журнале «Вода: химия и экология» № 6 за 2010 год, стр. 29-35.
Рубрика: Гидробиология

 

Хасаева Ф.М. к.б.н., докторант химического факультета Московского Государственного Университета им. М.В. Ломоносова
Василюк Н.В. аспирантка химического факультета Московского Государственного Университета им. М.В. Ломоносова
Лебедев А.Т. д.х.н., профессор химического факультета Московского Государственного Университета им. М.В. Ломоносова
Колганова Т.В. к.т.н., старший научный сотрудник Центра «Биоинженерия» РАН
Турова Т.П. д.б.н. ведущий научный сотрудник Института микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН

Аннотация:
Из почвенных образцов, подвергавшихся воздействию незамещенного пиридина, выделен штамм бактерий, утилизирующий пиридин. Согласно морфологическим, культуральным, физиолого-биохимическим признакам и анализу последовательности гена 16S pРНК изучаемый штамм бактерий отнесен к роду Rhodococcus wratislaviensis KM-P. Штамм способен в течение 26 ч полностью использовать 2,8 г/л пиридина в качестве единственного источника углерода, азота и энергии. Представлены масс-спектры культуры, снятые методом МАЛДИ-ВП на синапиновой кислоте.

Ключевые слова: Rhodococcus wratislaviensis, биодеградация, гидроксипиридин, пиридин, хроматомасс-спектрометрия, штамм - деструктор

Ссылка для цитирования:
Хасаева Ф.М. , Василюк Н.В., Лебедев А.Т. , Колганова Т.В. , Турова Т.П. Штамм бактерий Rhodococcus wratislaviensis KM-Р – деструктор незамещенного пиридина // Вода: химия и экология. — 2010. — № 6. — c. 29-35. — http://watchemec.ru/article/10184/

Литература:
1. Shukla O.P. Microbial decomposition of 2-ethylperidine, 2,4-lutidine and 2,4,6-collidine // Indian J. Exp. Biol. 1975. V.13. P. 574-575.
2. ГН 2.1.5.2280-07 Предельно допустимые концентрации (ПДК) химических веществ в воде водных объектов хозяйственно-питьевого и культурно-бытового водопользования. 2007.
3. Руководство к практическим занятиям по микробиологии // Под ред. Н.С. Егорова. 2-е изд. М.: Изд. МГУ, 1983. 215 с.
4. P.H.A. Sneath. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. V. 2. Baltimore: Williams & Wilkins. 1986.
5. Булыгина Е.С., Кузнецов Б.Б., Марусина А.И., и др. // Микробиология. 2002. Т. 71. № 4. С. 1-9.
6. Lane D. J. 16S/23S sequencing // In: Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Stacke brandt E. a. Goodfellow M. (Eds.). Chichester: John Wiley & Sons, Ltd., 1991. P. 115-175.
7. Sanger F. DNA sequencing with chainterminating inhibitors. // Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. V. 84. P. 5463-5467.
8. Thompson, J. D., Higgins, D.G. and Gibson, T.J. CLUSTAL W: Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight matrixchoice // Nucl. Acids Res. 1994. V.22. P. 4673-4680.
9. Van de Peer Y. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment / Van de Peer Y., De Wachter R. // Comput. Applic. Biosci. 1994. V. 10. P. 569-570.
10. Варфоломеев С.Д., Калюжный С.В. Биотехнология. Кинетические основы биологических процессов. М.: Высшая школа, 1990. 296 с.
11. Варфоломеев С.Д. Биотехнология. Кинетические основы биологических процессов / Варфоломеев С.Д., Калюжный С.В. // М.: Высшая школа, 1990. 296 с.
12. Smole S.C. Sample preparation of Grampositive bacteria for identification by matrix assisted laser desorption/ionization time-offlight / Smole S.C., King L.A., Leopold P.E., Arbeit R. // J. Microbiol. Methods. 2002. V. 48. P. 107-115.
13. Vargha M. Optimization of MALDI-TOF MS for strain level differentiation of Arthrobacter isolates / Vargha M., Takáts Z., Konopka A., Nakatsu C.H. // J. of Microbiol. Methods. 2006. V. 66. P. 399–409.
14. Stackebrandt E. Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology /Stackebrandt E., Goebel B.M. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1994. V. 44. № 4. P. 846-849.
15. Хасаева Ф.М., Терентьев П.Б. Изучение начальных путей катаболизма пиридина штаммом Arthrobacter sp. KM-Р // Вода: химия и экология. 2008. №4. С. 35-41.
16. Хасаева Ф.М., Терентьев П.Б. Изучение путей катаболизма пиридина штаммом Arthrobacter sp. KM-Р. //Вода: химия и экология.2008. № 6. С. 35-42.
17. Wilkins C.L., Lay J.O. Jr. Identification of Microorganisms by Mass Spectrometry. New Jersey: John Wiley & Sons, Inc. 2006. 357 p.
18. Nagy E. Species identification of clinical isolates of Bacteroides by matrix-assisted laserdesorption/ ionization time-of-flight mass spectrometry / Nagy E., Maier T., Urban E., Terhes G., Kostrzewa M. // Clin. Microbiol. Infect. 2009. V. 15. P. 796–802.